Protein Data Bankプロテインデータバンク

Protein Data Bankは、実験で決定されたタンパク質や核酸の立体構造を集めて公開するデータベースである。

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最終言及

Protein Data Bank(PDB)は、X線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)、クライオ電子顕微鏡(cryo-EM)などの実験で決定されたタンパク質や核酸などの生体分子の立体構造を集め、誰でも利用できるよう公開しているデータベースである。1971年に米国のブルックヘブン国立研究所で始まり、現在は複数の国の機関が共同で運営するWorldwide Protein Data Bank(wwPDB)が管理している。

構造生物学や創薬研究の基本的な資料であり、タンパク質構造予測AIモデルの学習や評価のデータとしても広く使われている。

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Google DeepMindのプッシュミート・コーリは、AlphaFoldが学習したのは、科学者がすでに決定してProtein Data Bank(PDB、実験で得たタンパク質構造の公開アーカイブ)に登録していた静的な構造の予測だったと強調します。


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